本課程是一門跨領域學科，內容分為兩大部分，前半學期講授鯨豚的生物學背景知識，例如分類、地理分布、型態適應、演化、生活史、攝食、社會結構及溝通智慧等；以及人類與海洋之間關係的過去、現在與未來、海洋保育的發展與歷史脈絡、探討海洋保育的理念與思想；並簡介保育生物學概念，學習保育生物學的主要理論與方法，並從各方面包含生態、經濟、人文等等探討如何落實海洋保育。後半學期則介紹鯨豚保育上的重要議題，例如捕鯨、漁業衝突、賞鯨發展、擱淺處理、海豚圈養及海洋保護區等。